I principali organismi di COST sono:
- CSO - Committee of Senior Officials: è l'organismo decisionale di Cost composto da rappresentanti degli Stati Membri, tra cui i Coordinatori Nazionali
- DC - Domain Committees:i comitati di dominio (settore) sono composti da esperti dei rispettivi domini e sono nominati dal CNC. I comitati relazionano al CSO e sono responsabili del controllo della qualità delle Azioni assegnate (valutazione, monitoraggio) . Effettuano anche la supervisione dello sviluppo strategico dei rispettivi domini;
- MC - Management Committees: i comitati di gestione hanno il compito di mettere in atto, supervisionare e coordinare le azioni Cost. Ciascun comitato è formato da non più di due rappresentanti di ciascun Stato firmatario.
- CNC - Cost National Coordinator: il coordinatore nazionale rappresenta il legame tra scienziati ed istituzioni del suo Paese ed il segretariato Cost (Commissione Europea).
